左梦庚带着左军的残兵败将，企图退到九江附近汇合郝效忠和张兴元的军队，撤往北面投降到清朝豪格部，九江附近还有五万左家军。只不过方国安的水师一直在死追他不放，此刻的何腾蛟的军队在收复湖北以后渐渐向九江的左军围了过去。袁继咸的守军一直是缩在九江城里防守，为的就是等待援军的到来要全歼这里的左军。
左梦庚与郝效忠和张兴元的军队汇合以后，自知打不过朱慈烺的军队，就想跨江退到北方，但是郝效忠和张兴元的军队在何腾蛟拿下湖北军中早就断了粮草军队状态远比左梦庚想象中还要差，每天都有大量的士兵在逃跑，左军的水师部队早在南京的水战中损失殆尽，左梦庚见此只得再度逃窜，与郝效忠和张兴元带几千家兵往北方逃去。
“你们的左帅已死，少帅左梦庚已经被我打的大败，现如今已经弃你们而去，你们还不快快投降，太子殿下乃大明正主，左良玉等叛将既然已经被诛杀，尔等不要再做无畏的抵抗”方国安带着水师在追到了九江附近大声说道。袁继咸在看到了援兵的到来，也率领城内守军冲杀剩余的左军，可怜的高家军刚加入进来就被抛弃了，成了断后的部队，四万多左军一瞬间四散而逃，战马发出惨痛的嘶鸣声，在逃跑的时候，不少的战马都被打到在地，摔到在地上做垂死的挣扎。但是，还是有部分左军幸运的逃亡了南方，很快就赢得了九江之战，俘虏了两万多，其余部队不知道逃到了哪里。
在清理完战场以后，袁继咸、何腾蛟、方国安便被朱慈烺召到了南京皇宫，在一片欢声笑语中开始了庆功“太子殿下，我们已经消灭了全部的左军，俘虏了一百多艘战舰和三万多士兵，您看如何处置”何腾蛟、方国安两人，向朱慈烺望去。
朱慈烺在知晓了左良玉的军队已经灰飞烟灭了以后，心情非常的好，这离中兴大明前进一大步，现在内部已经稳定，只要巩固地盘，恢复生产，未来跟大清的战争一定能赢“袁继咸、何腾蛟、方国安三位大臣辛苦了，这一次能够如此顺利的击败左良玉的军队，你们可都是功臣啊！袁总督以两三万守军抵挡左军十几万兵马半个月在九江一步都没有后退，为我军其他部队赢得胜利获取到充足时间；何腾蛟将军快速占领湖北，切断了左军的后路，让敌军方寸大乱；方国安一站而全歼左梦庚的水师，让左军无处逃窜，为我大明立下了赫赫战功，全部升三品加五百亩良田，布匹五百，金五百”
袁继咸、何腾蛟、方国安在获得了巨大的赏赐以后，纷纷感谢太子殿下。
朱慈烺在给大明的将军喝酒庆功以后，知道暂时还不能完成放松下来，目前击败的朱由崧和左良玉的军队战斗力很一般，从历史上来看，都是被清军一触即溃，清军的战斗力对于目前刚刚拉起来的三十万大军来说还是有很大的压力，便开口道“诸位大臣，我们也不能过分骄傲，要知道骄兵必败”参宴的大臣一起点头称是
朱慈烺接着又说“你们都是我大明的重臣，江南已经被我们收复了，你们觉得接下来怎么做”
此时这些大臣已经非常膨胀了，恨不得马上打回北京，史可法此时已是位极人臣，是真正意义上的只在朱慈烺一人之下，便带头说“太子殿下，我等以为您应该早日登基，好聚拢我大明的仁人义士，为先帝一雪前耻”
朱慈烺也知道是到了当皇帝的时间了，中国历朝历代都讲究一个正统，清朝已经是福临当皇帝，一直以太子的名义发号施令，容易被不断涌现的假太子一说影响江南的稳定，便严肃起来“史首辅，你说的很对，如今我父皇的陵寝还在大清的看管下，让我给父亲祭奠的机会都没有，对我大明来说是耻辱，我们君臣上下都要齐心协力驱除鞑虏”
何腾蛟等人在打败了左良玉以后，信心大增，想进一步建立功业，豪迈的说道“太子殿下，我等都愿意为明室肝脑涂地，只要您一声令下，我们就能打出黄河”
朱慈烺不由的挠了挠头，其实他还有一件事非常焦虑，就是福建的郑之龙和广东的丁魁寿都是一个不稳定的定时炸弹，如果不解决这个内部隐患，万一跟清军打起来，他们突然投降清军反咬一口，那后果不堪设想，等日后找个理由灭了他们，再跟清朝慢慢消耗“我知道你们的忠心，但眼下还不是时机，我们虽然统一了南方，但我们的敌人还是非常多，一旦往北方打，大西张献忠从四川进攻云贵，大顺李自成从陕西河南进攻湖北，你们又当如何热处理？”
在听到了朱慈烺的分析都沉默不语，文华殿大学士堵胤锡在思考了片刻开始了进一步分析，他还是非常的有远见之名的“太子殿下所言是大智慧，我大明如今在江南立足未稳，既有内患，外敌环绕，实在是不能再随意的进攻，应该效仿太祖皇帝，高筑墙，广屯粮，徐徐图之”
袁继咸觉得外敌说的很有道理，但是内患又是什么呢，如今他们不都遵从太子殿下，便困惑问到“堵大学士，你说的外敌我们都认同，可内患是谁呢，现在天下还有谁不听太子殿下的号令”
堵胤锡不紧不慢的解释道
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